内蒙古大学,作为中西部“一省一校”重点支持建设高校,同时也是国家“211工程”与“双一流”建设高校,在生命科学领域的研究表现尤为突出。其下属的生命科学学院是全球著名的生命科学研究机构,拥有生物学系(国家“双一流”建设学科)、农学系和生命科学本科实验教学示范中心等3个教学单位,以及多个省部级重点实验室和工程研究中心。学院积极参与中国家“863”、“973”、科技支撑计划等重大科研项目,在生命科学研究领域具有强大实力。
生物信息数据量呈指数级增长,算力、数据存储与处理面临更高挑战
生命科学研究需要对海量的生物信息数据进行快速处理、分析与挖掘,以研究生物体内的复杂过程,大规模数据量可达数十到数百TB。同时,过程中还将使用到很多统计学与计算机科学方法,以便于从“数据海洋”中提取有用的信息,这需要底层IT设施提供强大的算力支撑。
随着生命科学研究的不断深入,内蒙古大学产生的生物信息数据量呈指数级增长,这对底层IT设施提出了更高的要求。一方面,需要提供更高的算力来并行处理数据,支撑大数据分析工具与人工智能算法,以完成序列比对、转录组分析等计算工作。另一方面,需要海量的数据存储空间,存放原始数据、中间结果与最终分析结果,避免数据丢失或访问延迟。然而,现有的台式工作站面临严峻的性能瓶颈,其处理能力不足以处理复杂算法或大规模数据集,导致计算耗时长、可靠性低,对实验进度造成较大的影响。内蒙古大学亟需解决底层IT设施在算力、数据存储与处理速度方面的难题,进而提升生命科学研究的进度与效率。
生信分析业务软件繁多,底层操作系统兼容优化问题是重中之重
在当今生物信息学(生信)领域,海量数据的分析与处理工作涉及各类业务软件,覆盖了从数据预处理、表达分析、编译检测到高级功能注释等多个方面。然而,由于软件开发者的背景各异、技术栈不同,以及科研需求的多样化,生信分析业务软件存在接口不一等较大差异,其在底层操作系统上的兼容性与性能优化问题成为重中之重,直接关系到分析流程的顺畅与否、结果的准确性以及科研项目的进度。
为了解决内蒙古大学在智能化升级过程中的难题,浪潮信息提供了一套软硬协同解决方案。该方案以浪潮信息高端八路服务器TS860G7为算力底座,搭载最新一代英特尔CPU,提供强大算力支持;同时,通过浪潮信息统一存储AS5300G5提供高速、可靠、大容量的存储空间,满足持续增长的生物信息数据存储需求。进一步地,方案的底层操作系统采用了浪潮信息操作系统云峦KeyarchOS(以下简称KOS),KOS向下完全兼容,充分使能八路服务器TS860G7与统一存储AS5300G5,同时向上支撑十余款生信分析软件,实现业务系统高效、稳定运行。
上述方案的实施,为内蒙古大学的底层IT设施带来了全面的改善与提升,大幅度提升了生命科学研究的进度与效率。内蒙古大学将科研平台及十余款业务软件成功部署到KOS之上,通过软硬协同优化,利用八路服务器TS860G7支撑全部科学计算并大大缩短计算时间,同时利用AS5300G5满足未来5年的实验数据存储需求。
方案最大的亮点在于软硬协同的技术优势与底层操作系统的广泛兼容性。TS860G7与AS5300G5提供了强大的算力与存储空间,为整体IT设施奠定了有力的硬件支持;而KOS则充分释放了硬件性能,同时支撑十余款生信分析软件高效运行。这一方案在生命科学行业中具有领先性,为行业用户应对算力难题提供了全新的解决思路与技术支持。
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